酵母基因组DNA 的提取
大家好,今天小编来为大家解答以下的问题,关于酵母基因组DNA 的提取,这个很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!
(2)掌握酵母基因组DNA提取的方法和操作流程。
(3)熟练掌握琼脂糖凝胶电泳的操作流程。
【实验原理】酵母是单细胞真核生物,细胞膜外有细胞壁。提取酵母基因组DNA的关键是破坏细胞外的细胞壁。酵母裂解酶(Zymolyase)或壁面酶具有酵母细胞壁酶的活性。该方法使用解旋酶处理去除酿酒酵母的细胞壁。用SDS 溶液处理脱壁的酿酒酵母细胞,使细胞破裂,使蛋白质变性,并释放基因组DNA。然后在低温下用醋酸钾溶液处理,使基因组DNA 完全复性并将其溶解在水中。最后通过乙醇沉淀获得基因组。脱氧核糖核酸。该方法避免了苯酚、氯仿等有机溶剂的使用,使操作更加简单、安全。
【实验材料、试剂、仪器】
1、实验材料酿酒酵母菌株CJY151(也可以是其他酿酒酵母菌株)。
2. 实验试剂
(1)YPD培养基:1%酵母抽提物、2%蛋白胨、2%葡萄糖,低温灭菌20分钟。
(2)20mg/mL Zymolyase(酵母裂解酶)溶液:购自日本Seikagaku公司或美国Sigma公司。 (3)溶液A:1mol/L山梨醇,100mmol/L EDTA(pH 8.0)。
(4)溶液B:250mmol/L EDTA(pH8.0)、400mmol/L Tris-HCl(pH8.0)、2%SDS。
(5) 5mol/L KAc溶液:将49.1g醋酸钾溶解于100mL去离子水中,4保存。
(6)无水乙醇。
(7) 70%乙醇:用无菌水将70mL无水乙醇稀释至100mL。
(8) 含10 g/mL RNase A 的TE 缓冲液:10 mL TE 缓冲液[10 mmol/L Tris-HCl (pH8.0)、1 mmol/L EDTA (pH8.0),121高压灭菌20 分钟,备用]添加10 L 10 mg/mL RNase A 溶液。
(9) TE缓冲液(pH7.5):10mmol/L Tris-HCl(pH7.5)、1mmol/L EDTA(pH 8.0),121高压灭菌20分钟,备用。
(10)琼脂糖凝胶电泳相关试剂。
3实验仪器
台式高速离心机(每8人1套) 恒温水浴锅(每8人1套) 1.5mL无菌离心管(每人4支) 移液器(每2人1套) 1mL、200L无菌吸头(每人10支) 吸水纸(每4人1卷) 琼脂糖凝胶电泳相关设备
【实验步骤】
(1) 将酿酒酵母接种于5 mL YPD 液体培养基中,30振荡培养36 小时以上,取菌液1.5 mL,10000 r/min 离心2 分钟,收集细胞,弃去上清液。
(2) 加入500 L A溶液,摇匀。
(3)加入3L 20mg/mL Zymolyase溶液,37孵育1小时,5000r/min离心2分钟,弃上清。 (4) 加入400 L TE buffer (pH 7.5),吹打混匀,5000 r/min 离心2 min。丢弃上清液。
(5) 将细菌重悬于350 L TE 缓冲液(pH7.5) 中。
(6)加入90L溶液B,65水浴30分钟。
(7)加入80L 5mol/L KAc溶液,4静置2小时,然后4、12000r/min离心5分钟。
(8) 将上清液转移至1 mL无水乙醇中,4、12000 r/min离心5 min,弃上清液。
(9) 用0.4 mL 70%乙醇洗涤沉淀一次,4、12000 r/min离心5 min,弃上清。
(10) 用40 L无菌水溶解沉淀,备用。
(11) 如果需要去除产品中的RNA,请加入适量含10 g/mL RNase A的TE buffer,处理1小时。
(12)取10L样品进行0.8%琼脂糖凝胶电泳检测。
【实验笔记】
【典型实验结果分析】 1、理想的实验结果(见图5.2,泳道1)是DNA分子大于23kb,条带清晰,可直接用于后续分子生物学操作。如果不去除RNA,凝胶前端会出现大量RNA 条带。由于RNA的存在并不影响后续的分子生物学操作,因此在酵母基因组DNA提取过程中可以省略此步骤。
图5.2 酿酒酵母基因组DNA 1M:DNA分子大小标准参考物质琼脂糖凝胶电泳结果; 1~2:酿酒酵母基因组DNA(RNA未去除)
图5.3 酿酒酵母基因组DNA琼脂糖凝胶电泳结果2
M:DNA分子大小标准参考物质; 1~2:酿酒酵母基因组DNA,均出现一定程度的降解,其中1孔降解程度较严重2.典型实验结果1(见图5.3,泳道2)DNA分子大小正常,条带清晰,但条带亮度较弱,说明DNA量较少。解决方案:增加大肠杆菌细胞数量并重新提取。
3典型实验结果2(见图5.3,泳道1)条带弥漫且模糊,严重时可能出现阶梯状条带,表明获得的基因组DNA被降解。常见原因包括:手术过程中过度运动,导致基因组DNA断裂;用于去除RNA 的RNase 与DNase 混合。解决方案:重新提取DNA,
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用户评论
好文章!这篇博客详细介绍了酵母基因组DNA的提取过程步骤,图画也很清楚易懂。作为对分子生物学的入门者,这篇文章帮我了解了很多概念,感觉自己更能理解这个学科了!
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对于科研人员来说,这篇博客讲解的提取方法挺实用。虽然基本原理大家都明白,但是文章把每一个步骤都清晰描述出来非常方便快速地查阅参考!
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作者解释酵母基因组DNA提取过程比较详细,从试剂选择到操作步骤都介绍的很全面,很有用!
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这篇博文虽然专业一点,但我还是受益良多。我正在学习基因工程,这篇文章让我更深入地了解了DNA的提取,尤其是酵母基因组DNA的特殊之处。
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我对提取方法不太熟悉,读完文章发现酵母基因组DNA的提取过程确实比较复杂, 需要精准的操作和精确的步骤!
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我觉得文章中提到的几种不同提取技术的优缺点分析很有价值,能够帮助我们选择最适合自己的方法。
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文章介绍的仪器设备和试剂品牌,对于新手来说很有指导意义。我打算下次用这些工具做实验的时候参考一下这篇博客!
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这种酵母基因组DNA的提取方法在实验室中应用比较普遍,非常实用!
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感觉文章有点过于详细,很多细节我不太需要知道,希望可以简化一些内容,重点突出关键信息。
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我更偏向于视频教程进行学习,这样的文章对我来说不太友好。如果能结合视频演示更好!
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我对分子生物学很有兴趣,但是这篇博文写的有些专业,感觉理解起来比较困难。
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文章虽然详细,但缺少实验数据和案例分析,显得不够生动!希望作者能够补充更多实例如例说明。
有8位网友表示赞同!
我一直在做酵母基因组研究,这篇博客提供的提取方法让我很有启发。 尤其是他对不同提取技术的对比分析非常有帮助。
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从文章中了解到很多新知识,尤其是对酵母基因组结构和特殊性质的描述非常有趣!
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我觉得这个博文挺重要的,毕竟酵母基因组DNA在科研中应用很广泛,掌握正确的提取方法很重要。
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作者的语言风格比较学术化,读起来有些枯燥。希望文章能够加入更多趣味元素,更吸引读者阅读。
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文章对提取过程中的可能问题和解决方法都没有详细说明,对于遇到问题的读者来说没有太大帮助。
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