安徽医科大学临床医学院是2003年由安徽医科大学创建，是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院；学院秉承安徽医科大学90余年的文化传统和办学理念，坚持“以教学为中心，以学生为主体”的办学宗旨，坚持“科学定位，特色办学、质量兴校”的发展思路。2017年11月遵照教育部26号令要求，由安徽医科大学与安徽新华集团投资有限公司合作举办，是按新机制和新模式运行的本科高校。

据2019年9月学院官网显示，学院先后建立了基础医学部、临床医学系、卫生管理学系、护理学系、药学系、公共课程部、思想政治理论课教学研究部和生物医学系，设有临床医学、康复治疗学、医学影像技术、护理学、药学、生物医学工程和公共事业管理等本科专业。